本處於79至96年期間，將轄內各站主要圳路之幹線及重要構造物分年分期予以改善，舉其犖犖大者略分為16條圳路，總執行金額909,503,581元，詳如下表：
| 編號 | 工程名稱 | 總執行金額 |
|---|---|---|
| 1 | 池上圳幹線歷年工程 | 45,673,709 |
| 2 | 關山大圳幹線歷年改善工程 | 133,468,909 |
| 3 | 電光圳幹線歷年改善工程 | 15,985,165 |
| 4 | 豐源圳幹線歷年改善工程 | 41,315,942 |
| 5 | 鹿野大圳幹線歷年改善工程 | 53,374,006 |
| 6 | 鹿野大圳龍田噴灌區歷年改善工程 | 122,341,395 |
| 7 | 卑南上圳進水口歷年修復及改善工程 | 71,875,324 |
| 8 | 卑南上圳十股地區旱作灌溉系統歷年興建工程 | 21,189,791 |
| 9 | 利家圳幹線歷年改善工程 | 23,317,854 |
| 10 | 知本圳幹線歷年改善工程 | 28,440,000 |
| 11 | 美和圳幹線歷年改善工程 | 18,339,885 |
| 12 | 香蘭圳幹線及進水口歷年改善工程 | 17,021,164 |
| 13 | 卑南圳幹線歷年改善工程 | 229,108,621 |
| 14 | 小馬圳幹線歷年改善工程 | 37,961,126 |
| 15 | 長濱大圳幹線歷年改善工程 | 33,336,690 |
| 16 | 新港圳系統歷年改善工程 | 16,754,000 |
| 合計 | 909,503,581 | |